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197 résultats
keyword_s : Bioinformatics
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Caractérisation des erreurs de séquençage non aléatoires, application aux mosaïques et tumeurs hétérogènes

 Chadi Saad
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Lille Nord de France, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-01936291v1
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Compter les globules blancs, analyser les partitions

 Mathieu Giraud
Informatique [cs]. Université de Lille 1 – Sciences et Technologies, 2016
HDR tel-01577763v1
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Rule-based meta-modelling for bio-curation

 Russell Harmer
Bioinformatics [q-bio.QM]. Ecole Normale Supérieure de Lyon, 2017
HDR tel-01534703v1
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Model-based Identification of Helitrons Results in a New Classification of Their Families in Arabidopsis thaliana

 Sébastien Tempel , Jacques Nicolas , Abdelhak El Amrani , Ivan Couée
Gene, 2007, 403 (1-2), ⟨10.1016/j.gene.2007.06.030⟩
Article dans une revue inria-00180376v1
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Fast and accurate genome-scale identification of DNA-binding sites

 David Martin , Vincent Maillol , Eric Rivals
BIBM: Bioinformatics and Biomedicine, Dec 2018, Madrid, Spain. pp.201-205, ⟨10.1109/BIBM.2018.8621093⟩
Communication dans un congrès lirmm-01967466v1
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Seamless Coarse Grained Parallelism Integration in Intensive Bioinformatics Workflows

 François Moreews , Dominique Lavenier
2016
Pré-publication, Document de travail hal-00908842v1
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To detect and analyze sequence repeats whatever be their origin

 Jacques Nicolas
Yves Bigot. Mobile genetic elements : protocols and genomic applications, 859, Springer, pp.69-90, 2012, Springer Protocols, 978-1-61779-602-9. ⟨10.1007/978-1-61779-603-6⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00730207v1
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Parallel Position Weight Matrices Algorithms

 Mathieu Giraud , Jean-Stéphane Varré
Parallel Computing, 2011, 37, pp.466-478. ⟨10.1016/j.parco.2010.10.001⟩
Article dans une revue hal-00623404v1

QBIOS: driving toward a trusted distributed bioinformatics service infrastructure

 François Moreews
ISMB 2009 - International Conference On Intelligent Systems for Molecular Biology, Jun 2009, Stockholm, Sweden
Communication dans un congrès inria-00435755v1
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Graphics Processing Unit-Accelerated Quantitative Trait Loci Detection

 Guillaume Chapuis , Olivier Filangi , Jean Michel J. M. Elsen , Dominique Lavenier , Pascale Le Roy
Journal of Computational Biology, 2013, 20 (9), pp.672-686. ⟨10.1089/cmb.2012.0136⟩
Article dans une revue hal-00903794v1
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Using hybrid concurrent constraint programming to model dynamic biological systems

 Alexander Bockmayr , Arnaud Courtois
[Intern report] A02-R-026 || bockmayr02a, 2002, 15 p
Rapport inria-00107635v1

Regulation of the vitamin B(12) metabolism and transport in bacteria by a conserved RNA structural element.

 Alexey Vitreschak , Dmitry Rodionov , Andrey Mironov , Mikhail Gelfand
RNA, 2003, 9 (9), pp.1084-1097
Article dans une revue inria-00099647v1
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DiscoSnp-RAD: de novo detection of small variants for RAD-Seq population genomics

 Jérémy Gauthier , Charlotte Mouden , Tomasz Suchan , Nadir Alvarez , Nils Arrigo , et al.
PeerJ, 2020, pp.1-20. ⟨10.7717/peerj.9291⟩
Article dans une revue hal-01634232v4
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Contributions à l'extraction de connaissances à partir de données biologiques

 Malika Smaïl-Tabbone
Apprentissage [cs.LG]. Université de Lorraine, 2014
HDR tel-01093943v2
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Évolution des génomes mitochondriaux de plantes : approche de génomique comparative chez Zea mays et Beta vulgaris

 Aude Darracq
Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00833144v1
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A Kernel for Protein Secondary Structure Prediction

 Yann Guermeur , Alain Lifchitz , Régis Vert
Bernhard Schölkopf, Koji Tsuda, Jean-Philippe Vert. Kernel Methods in Computational Biology, The MIT Press, Cambridge, Massachussetts, pp.193-206, 2004, 0-262-19509-7
Chapitre d'ouvrage hal-00012701v2

Next Generation Data Integration for the Life Sciences

 Sarah Cohen-Boulakia , Ulf Leser
IEEE International Conference on Data Engineering (ICDE), Apr 2011, Hannover, Germany
Communication dans un congrès inria-00542359v1
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FCA in a Logical Programming Setting for Visualization-oriented Graph Compression

 Lucas Bourneuf , Jacques Nicolas
International Conference on Formal Concept Analysis 2017, Jun 2017, Rennes, France. ⟨10.1007/978-3-319-59271-8_6⟩
Communication dans un congrès hal-01558302v1

Porins and Amyloids are Coded by Similar Sequence Motifs

 Etienne Villain , Aleksei Nikekhin , Andrey Kajava
Proteomics, 2018, 19 (6), pp.1800075. ⟨10.1002/pmic.201800075⟩
Article dans une revue hal-02414022v1

A Reconfigurable Index FLASH Memory tailored to Seed-Based Genomic Sequence Comparison Algorithms

 Dominique Lavenier , Gilles Georges , Xinchun Liu
The Journal of VLSI Signal, 2007, 48 (3), pp.255-269. ⟨10.1007/s11265-007-0073-6⟩
Article dans une revue istex inria-00178314v1

Hardware Acceleration of HMMER on FPGAs

 Steven Derrien , Patrice Quinton
Journal of Signal Processing Systems, 2010, 58 (1), pp.53-67. ⟨10.1007/s11265-008-0262-y⟩
Article dans une revue istex inria-00453947v1
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Exploiting Complex Protein Domain Networks for Protein Function Annotation

 Bishnu Sarker , David W Ritchie , Sabeur Aridhi
Complex Networks 2018 - 7th International Conference on Complex Networks and Their Applications, Dec 2018, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-01920595v1
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CP games : a tutorial

 Pierre Lescanne
2007
Pré-publication, Document de travail ensl-00121361v3

Comparative genomics of the vitamin B12 metabolism and regulation in prokaryotes

 Dmitry Rodionov , Alexey Vitreschak , Andrey Mironov , Mikhail Gelfand
Journal of Biological Chemistry, 2003, 272 (42), pp.41148-41159
Article dans une revue inria-00099646v1

Regulation of lysine biosynthesis and transport genes in bacteria: yet another RNA riboswitch?

 Dmitry Rodionov , Alexey Vitreschak , Andrey Mironov , Mikhail Gelfand
Nucleic Acids Research, 2003, 31 (23), pp.1-10
Article dans une revue inria-00099648v1
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Analyse et déploiement de solutions algorithmiques et logicielles pour des applications bioinformatiques à grande échelle sur la grille

 Raphaël Bolze
Modélisation et simulation. Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2008. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00344249v1

Proceedings of the 1st workshop on Computational Methods for Structural RNAs

 Fabrice Jossinet , Yann Ponty , Jérôme Waldispühl
Jossinet, Fabrice; Ponty, Yann; Waldispühl, Jérôme. McGill University, pp.76, 2014, 978-2-9550187-0-5. ⟨10.15455/CMSR.2014.0000⟩
Ouvrages hal-01071417v1
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Analysis of Large-Scale Biological Networks with Constraint-Based Approaches over Static Models

 Carito Guziolowski
Other [cs.OH]. Université Rennes 1, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00541903v1
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Novel definition and algorithm for chaining fragments with proportional overlaps

 Raluca Uricaru , Alban Mancheron , Eric Rivals
Journal of Computational Biology, 2011, 18 (9), pp.1141-1154. ⟨10.1089/cmb.2011.0126⟩
Article dans une revue lirmm-00834143v1
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Concevoir et partager des workflows d’analyse de données : application aux traitements intensifs en bioinformatique

 François Moreews
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2015. Français. ⟨NNT : 2015REN1S089⟩
Thèse tel-01308297v2
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